繁华大都会美国纽约，邪恶领袖施莱德率领的大脚帮在城市内为非作歹，甚嚣尘上。安保公司老板埃里克·萨克斯推出最新安保系统，发誓维护城市的和平。第6频道女记者爱普尔·奥尼尔偶然拍到大脚帮被四名神秘侠客挫败的画面，在第二次遭遇非常事件时，她惊讶地发现四名侠客竟然是变异后的巴西龟：拉斐尔、列奥纳多、米可朗基罗、多纳泰罗。忍者神龟的名字勾起了爱普尔儿时的记忆，当年她的父亲与萨克斯正是研究生物变异实验的伙伴。她将这个消息告诉给萨克斯，可是在和忍者神龟及其老师斯普林特会面后，才发觉萨克斯与施莱德是这座城市内的罪恶之源……

十二岁的腊肠犬“江米条”，在女主人离婚的这天，滑稽的走完了它的狗生。忘掉主人是狗狗们来到汪星世界要做的第一件事。汪星世界的掌门是一条叫“侠客”的巴哥犬，它热情的为江米条服务着。倔强的江米条不愿忘记主人，把掌门“侠客”揍了一顿，强行拽着侠客重返人间……

故事讲述石中坚（郭振峰 饰）自幼随养母梅芳姑于深山居住，一日偶拾「玄铁令」，并得谢烟客传授武功，却被长乐帮帮众误认为帮主石中玉；及后更被丁珰所骗，愿意替石中玉到雪山派代罪领死。最后真相大白，石中坚竟为石清失散多年的儿子。