西元二○二一年，人类在与病毒性寄生生物“原肠动物”的战争中败北，被驱逐至狭窄的领土，带着恐惧与绝望苟且偷生。至此过了十年，人类在能控制原肠动物病毒的少女们“受诅之子”力量下得以找到对抗怪物的最后希望，然而过去的伤痛却使两者之间出现难以填平的代沟，看似得到和平的人类社会正悄悄变质，暗潮越见汹涌。居住于东京的高中生少年里见莲太郎，是一位专门对抗原肠动物的“民警”中其中一份子，与自己的搭挡蓝原延珠一起从事许多危险的工作，就在某天接获政府的特别命令，内容竟是避免东京毁灭的高度机密任务……

麦圈是初中二年级的学生，有小聪明却成绩一直不好。可可是麦圈的堂妹，成绩优秀却有些任性。肉丸是他们家的宠物狗，贪吃可爱却有一股莫名的神奇力量。为了解决作业问题和取得好成绩，麦圈经过肉丸的指点，与可可一起去天童寺拜师学艺。为了能顺利拜师，他们接受了天童寺主持的三个要求，并为此游历了东钱湖、梁祝文化公园、走马塘等宁波大小旅游景点，历经了一段奇异的旅程。在惊险和困难中他们懂得了世上无难事，只怕有心人。

麦圈、可可及宠物狗肉丸收到天童寺饭团师叔的飞信传书，天童寺中记载时间万物进化过程、动植物习性的宝书《乾坤宝鉴》被盗。两人一狗为帮助饭团师叔寻回宝鉴，在凤凰山、雅戈尔动物园、天宫庄园植物园等地经历了一系列的冒险，终于成功寻回《乾坤宝鉴》。