又一场狂风骤雨随着日出东方悄然逝去，粉碎了反秦联盟的刺杀行动，大秦帝国的统治表面上再次复归于平静，就仿佛昨夜什么也不曾发生。秦始皇运筹帷幄，对天下反秦势力进行了一次成功的大清洗，迫使反秦势力悄悄隐匿入广阔的江湖之中，修养生息，由此引发的焚书坑儒事件，也使秦始皇得以成功铲除异已，蜃楼也终于扬帆起航，开往海外去寻找长生不老药。然而，大秦帝国千秋万代的道路上仍然存在着诸多不可忽视的阻碍，一直对中原虎视眈眈的北方狼族，在长期的蛰伏之后，再次爆发起对中原的新一轮冲击，日益频繁的戍边战事，令帝国的铁骑疲于应付。

《秦时明月之君临天下》是国产大型3D动画《秦时明月》的第五部。继续之前的剧情，第五部中，将会讲述蒙恬出击匈奴、秦皇东巡、焚书坑儒、蜃楼东渡……等一系列历史故事。

一个风雨交加的夜晚，布兰德尔太太维拉回到开诊所的家中，发现丈夫布兰德尔医生被人麻醉在诊所的手术台上，并被切掉了鼻尖。第二天上午，布兰德尔太太到警察局找老同学索菲·弗莱明寻求帮助。索菲正在练习柔道，听说老同学来了马上赶来见她。起初索菲甚至认不出来老朋友了，岁月的沧桑已经彻底改变了维拉的容颜。就在妻子为丈夫奔走时，丈夫却在诊所里与护士鬼混。看在朋友的面子上，索菲答应与维拉的丈夫布兰德尔医生谈谈，但是布兰德尔似乎很郁闷，不愿意交流，也不愿意与警察配合。索菲花费了许多时间，事情却毫无进展。就在索菲与助手离开时，发

某一天，太平洋的中心突然出现了一片新的大陆，后来人们称之为圣洲。圣洲有着与现今所知的人类世界完全不同的生态系统，全新的物种，各种奇妙的自然现象，珍惜的矿物，这片大陆代表着无尽的未知和财富，同时也隐藏着未知的危险。每年有95万人在圣洲中遇难。主角因又和阿零经营着一家奇怪的店铺——拾人馆，这个店铺的主要业务就是去圣洲中拯救遇到危险而无法逃离的探险家，而他们的冒险就伴随着一次次的救助活动展开……